上海地铁16号线航头东站位于浦东新区航头镇，是16号线的南端终点站。该站并非换乘车站，因此不涉及与其他地铁线路的换乘。

航头东站周边以居民区为主，覆盖航头镇及周边社区的常住人口，同时也有部分商业设施和学校，乘客以周边居民、上班族和学生为主，人群结构较为稳定。

航头东站作为16号线的终点站，客流量相对适中，平日以通勤客流为主，早晚高峰时段人流较为集中。由于地处浦东新区南部，节假日客流可能因周边休闲活动略有增加，但整体客流量较市区线路偏低。